Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY83

Pcdh7, Protocadherin 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh7A0A0A6YY83 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdh7A0A0A6YY83 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdh7A0A0A6YY83 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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