Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpf2Q9JJ80 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpf2Q9JJ80 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.9 ms