Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9L5

Actrt2, Actin-related protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt2Q9D9L5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actrt2Q9D9L5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actrt2Q9D9L5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actrt2Q9D9L5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actrt2Q9D9L5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actrt2Q9D9L5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actrt2Q9D9L5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Actrt2Q9D9L5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actrt2Q9D9L5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actrt2Q9D9L5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actrt2Q9D9L5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actrt2Q9D9L5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actrt2Q9D9L5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actrt2Q9D9L5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actrt2Q9D9L5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actrt2Q9D9L5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Actrt2Q9D9L5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actrt2Q9D9L5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actrt2Q9D9L5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Actrt2Q9D9L5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Actrt2Q9D9L5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms