Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms