Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmed5Q9CXE7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmed5Q9CXE7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms