Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tlcd1Q99JT6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tlcd1Q99JT6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlcd1Q99JT6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms