Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krcc1Q99JT5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krcc1Q99JT5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krcc1Q99JT5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krcc1Q99JT5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krcc1Q99JT5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krcc1Q99JT5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krcc1Q99JT5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krcc1Q99JT5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krcc1Q99JT5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krcc1Q99JT5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krcc1Q99JT5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krcc1Q99JT5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krcc1Q99JT5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krcc1Q99JT5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krcc1Q99JT5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Krcc1Q99JT5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Krcc1Q99JT5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Krcc1Q99JT5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Krcc1Q99JT5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Krcc1Q99JT5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krcc1Q99JT5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krcc1Q99JT5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms