Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc1Q91Z38 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc1Q91Z38 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms