Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arcn1Q5XJY5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Arcn1Q5XJY5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arcn1Q5XJY5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Arcn1Q5XJY5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Arcn1Q5XJY5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Arcn1Q5XJY5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Arcn1Q5XJY5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Arcn1Q5XJY5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Arcn1Q5XJY5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arcn1Q5XJY5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms