Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim15Q3UTD9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 749.4 ms