Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gdpd4Q3TT99 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gdpd4Q3TT99 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms