Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPA6

Helq, Helicase POLQ-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelqQ2VPA6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HelqQ2VPA6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HelqQ2VPA6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HelqQ2VPA6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HelqQ2VPA6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HelqQ2VPA6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HelqQ2VPA6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HelqQ2VPA6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HelqQ2VPA6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HelqQ2VPA6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HelqQ2VPA6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HelqQ2VPA6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HelqQ2VPA6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HelqQ2VPA6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HelqQ2VPA6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HelqQ2VPA6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HelqQ2VPA6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HelqQ2VPA6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HelqQ2VPA6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms