Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 YGL235WYGL235W 537 nt6.3□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 GTO1YGR154C 1071 nt6.3□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 HGH1YGR187C 1185 nt6.3□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 SPC42YKL042W 1092 nt6.3□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 UBC12YLR306W 567 nt6.3□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 YNL228WYNL228W 777 nt6.3□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 RMD9YGL107C 1941 nt6.3□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 KTR5YNL029C 1569 nt6.3□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 FET4YMR319C 1659 nt6.3□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 SAS4YDR181C 1446 nt6.29□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 REX3YLR107W 1215 nt6.29□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 DUS4YLR405W 1104 nt6.29□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 GFD1YMR255W 567 nt6.29□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 RPS3YNL178W 723 nt6.29□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 LDB16YCL005W 771 nt6.29□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 ATG18YFR021W 1503 nt6.29□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 RCK1YGL158W 1539 nt6.29□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 VHT1YGR065C 1782 nt6.29□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 SNF11YDR073W 510 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 ADD66YKL206C 804 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 PNP1YLR209C 936 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 ESC8YOL017W 2145 nt6.28□□□□□ -1.4
SGO1Q08490 AMD2YDR242W 1650 nt6.27□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt6.27□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.27□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 DAL3YIR032C 588 nt6.27□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 YKR032WYKR032W 315 nt6.27□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 YLR283WYLR283W 945 nt6.27□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 SNO4YMR322C 714 nt6.27□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 HSP33YOR391C 714 nt6.27□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 POS5YPL188W 1245 nt6.27□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.27□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 HSP32YPL280W 714 nt6.27□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 YDR132CYDR132C 1488 nt6.27□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 PRY3YJL078C 2646 nt6.27□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 PMT3YOR321W 2262 nt6.27□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 CLD1YGR110W 1338 nt6.26□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 YDR415CYDR415C 1125 nt6.26□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 PCL6YER059W 1263 nt6.26□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 ARC19YKL013C 516 nt6.26□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 MEH1YKR007W 555 nt6.26□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 ARR1YPR199C 885 nt6.26□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 YEF1YEL041W 1488 nt6.26□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 HEM1YDR232W 1647 nt6.25□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 HXT15YDL245C 1704 nt6.25□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 HXT16YJR158W 1704 nt6.25□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 STB5YHR178W 2232 nt6.25□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 MED2YDL005C 1296 nt6.25□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 MIA40YKL195W 1212 nt6.25□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 RRT7YLL030C 342 nt6.25□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 SEC13YLR208W 894 nt6.25□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 NMD4YLR363C 657 nt6.25□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 EDE1YBL047C 4146 nt6.25□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 snR57snR57 88 nt6.24□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt6.24□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 YDL129WYDL129W 876 nt6.24□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 MRPL25YGR076C 474 nt6.24□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 YJR056CYJR056C 711 nt6.24□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 LDB18YLL049W 540 nt6.24□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 VTA1YLR181C 993 nt6.24□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 DAP1YPL170W 459 nt6.24□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 COR1YBL045C 1374 nt6.23□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 HER2YMR293C 1395 nt6.23□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 MAF1YDR005C 1188 nt6.23□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 RTN1YDR233C 888 nt6.23□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 GPI11YDR302W 660 nt6.23□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 YIL077CYIL077C 963 nt6.23□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 YML012C-AYML012C-A 378 nt6.23□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 YNL120CYNL120C 486 nt6.23□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 AME1YBR211C 975 nt6.23□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 NHA1YLR138W 2958 nt6.22□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 CRP1YHR146W 1398 nt6.22□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 RIX7YLL034C 2514 nt6.22□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 ADY2YCR010C 852 nt6.22□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 CBP4YGR174C 513 nt6.22□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 OAC1YKL120W 975 nt6.22□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 UTR2YEL040W 1404 nt6.22□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 GUS1YGL245W 2127 nt6.22□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 YDR514CYDR514C 1452 nt6.22□□□□□ -1.41
SGO1Q08490 HIS7YBR248C 1659 nt6.21□□□□□ -1.42
SGO1Q08490 IMG2YCR071C 441 nt6.21□□□□□ -1.42
SGO1Q08490 COX9YDL067C 180 nt6.21□□□□□ -1.42
SGO1Q08490 YPT1YFL038C 621 nt6.21□□□□□ -1.42
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