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Protein–RNA interactions for Protein: Q08490
SGO1, Shugoshin, yeast
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590 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SGO1
Q08490
YGL235W
YGL235W
537 nt
6.3
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
GTO1
YGR154C
1071 nt
6.3
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
HGH1
YGR187C
1185 nt
6.3
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
SPC42
YKL042W
1092 nt
6.3
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
UBC12
YLR306W
567 nt
6.3
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
YNL228W
YNL228W
777 nt
6.3
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
RMD9
YGL107C
1941 nt
6.3
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
KTR5
YNL029C
1569 nt
6.3
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
FET4
YMR319C
1659 nt
6.3
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
SAS4
YDR181C
1446 nt
6.29
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
REX3
YLR107W
1215 nt
6.29
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
DUS4
YLR405W
1104 nt
6.29
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
GFD1
YMR255W
567 nt
6.29
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
RPS3
YNL178W
723 nt
6.29
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
LDB16
YCL005W
771 nt
6.29
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
ATG18
YFR021W
1503 nt
6.29
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
RCK1
YGL158W
1539 nt
6.29
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
VHT1
YGR065C
1782 nt
6.29
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
SNF11
YDR073W
510 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
tG(GCC)B
tG(GCC)B
71 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
SUF16
tG(GCC)C
71 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
tG(GCC)D1
tG(GCC)D1
71 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
tG(GCC)D2
tG(GCC)D2
71 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
tG(GCC)E
tG(GCC)E
71 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
SUF20
tG(GCC)F1
71 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
tG(GCC)F2
tG(GCC)F2
71 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
tG(GCC)G1
tG(GCC)G1
71 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
tG(GCC)G2
tG(GCC)G2
71 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
tG(GCC)J1
tG(GCC)J1
71 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
SUF23
tG(GCC)J2
71 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
tG(GCC)M
tG(GCC)M
71 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
tG(GCC)O1
tG(GCC)O1
71 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
SUF17
tG(GCC)O2
71 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
tG(GCC)P1
tG(GCC)P1
71 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
tG(GCC)P2
tG(GCC)P2
71 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
YAL016C-B
YAL016C-B
186 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
ADD66
YKL206C
804 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
PNP1
YLR209C
936 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
ESC8
YOL017W
2145 nt
6.28
□□□□□ -1.4
SGO1
Q08490
AMD2
YDR242W
1650 nt
6.27
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
YDL085C-A
YDL085C-A
207 nt
6.27
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
SUF5
tG(CCC)O
72 nt
6.27
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
DAL3
YIR032C
588 nt
6.27
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
YKR032W
YKR032W
315 nt
6.27
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
YLR283W
YLR283W
945 nt
6.27
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
SNO4
YMR322C
714 nt
6.27
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
HSP33
YOR391C
714 nt
6.27
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
POS5
YPL188W
1245 nt
6.27
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
YPL250W-A
YPL250W-A
288 nt
6.27
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
HSP32
YPL280W
714 nt
6.27
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
YDR132C
YDR132C
1488 nt
6.27
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
PRY3
YJL078C
2646 nt
6.27
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
PMT3
YOR321W
2262 nt
6.27
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
CLD1
YGR110W
1338 nt
6.26
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
YDR415C
YDR415C
1125 nt
6.26
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
PCL6
YER059W
1263 nt
6.26
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
ARC19
YKL013C
516 nt
6.26
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
MEH1
YKR007W
555 nt
6.26
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
ARR1
YPR199C
885 nt
6.26
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
YEF1
YEL041W
1488 nt
6.26
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
HEM1
YDR232W
1647 nt
6.25
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
HXT15
YDL245C
1704 nt
6.25
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
HXT16
YJR158W
1704 nt
6.25
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
STB5
YHR178W
2232 nt
6.25
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
MED2
YDL005C
1296 nt
6.25
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
MIA40
YKL195W
1212 nt
6.25
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
RRT7
YLL030C
342 nt
6.25
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
SEC13
YLR208W
894 nt
6.25
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
NMD4
YLR363C
657 nt
6.25
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
EDE1
YBL047C
4146 nt
6.25
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
snR57
snR57
88 nt
6.24
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
YDL022C-A
YDL022C-A
249 nt
6.24
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
YDL129W
YDL129W
876 nt
6.24
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
MRPL25
YGR076C
474 nt
6.24
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
YJR056C
YJR056C
711 nt
6.24
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
LDB18
YLL049W
540 nt
6.24
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
VTA1
YLR181C
993 nt
6.24
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
DAP1
YPL170W
459 nt
6.24
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
COR1
YBL045C
1374 nt
6.23
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
HER2
YMR293C
1395 nt
6.23
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
MAF1
YDR005C
1188 nt
6.23
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
RTN1
YDR233C
888 nt
6.23
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
GPI11
YDR302W
660 nt
6.23
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
YIL077C
YIL077C
963 nt
6.23
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
YML012C-A
YML012C-A
378 nt
6.23
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
YNL120C
YNL120C
486 nt
6.23
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
AME1
YBR211C
975 nt
6.23
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
NHA1
YLR138W
2958 nt
6.22
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
CRP1
YHR146W
1398 nt
6.22
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
RIX7
YLL034C
2514 nt
6.22
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
ADY2
YCR010C
852 nt
6.22
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
CBP4
YGR174C
513 nt
6.22
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
OAC1
YKL120W
975 nt
6.22
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
UTR2
YEL040W
1404 nt
6.22
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
GUS1
YGL245W
2127 nt
6.22
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
YDR514C
YDR514C
1452 nt
6.22
□□□□□ -1.41
SGO1
Q08490
HIS7
YBR248C
1659 nt
6.21
□□□□□ -1.42
SGO1
Q08490
IMG2
YCR071C
441 nt
6.21
□□□□□ -1.42
SGO1
Q08490
COX9
YDL067C
180 nt
6.21
□□□□□ -1.42
SGO1
Q08490
YPT1
YFL038C
621 nt
6.21
□□□□□ -1.42
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