Protein–RNA interactions for Protein: Q04368

CSI1, Cop9 signalosome-interactor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI1Q04368 OAC1YKL120W 975 nt6.85□□□□□ -1.31
CSI1Q04368 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt6.85□□□□□ -1.31
CSI1Q04368 ATP1YBL099W 1638 nt6.85□□□□□ -1.31
CSI1Q04368 BUL1YMR275C 2931 nt6.85□□□□□ -1.31
CSI1Q04368 RGD1YBR260C 2001 nt6.84□□□□□ -1.31
CSI1Q04368 SGV1YPR161C 1974 nt6.84□□□□□ -1.31
CSI1Q04368 MID1YNL291C 1647 nt6.84□□□□□ -1.31
CSI1Q04368 ADY2YCR010C 852 nt6.84□□□□□ -1.31
CSI1Q04368 EFM4YIL064W 774 nt6.84□□□□□ -1.31
CSI1Q04368 YOR300WYOR300W 309 nt6.84□□□□□ -1.31
CSI1Q04368 HSM3YBR272C 1443 nt6.84□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 VMA2YBR127C 1554 nt6.83□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt6.83□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt6.83□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt6.83□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt6.83□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt6.83□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt6.83□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt6.83□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt6.83□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt6.83□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt6.83□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 NHP6BYBR089C-A 300 nt6.83□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 MRPL36YBR122C 534 nt6.83□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 HCR1YLR192C 798 nt6.82□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 SNZ3YFL059W 897 nt6.81□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 SNZ2YNL333W 897 nt6.81□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 GYP1YOR070C 1914 nt6.81□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 RHB1YCR027C 630 nt6.8□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 STL1YDR536W 1710 nt6.8□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 SHE10YGL228W 1734 nt6.8□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 HSX1tR(CCU)J 72 nt6.8□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 CSC1YLR241W 2349 nt6.8□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 YDL034WYDL034W 345 nt6.79□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 PGA3YML125C 939 nt6.79□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 ARG1YOL058W 1263 nt6.79□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 YOL131WYOL131W 327 nt6.79□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 KEX2YNL238W 2445 nt6.79□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 KEL1YHR158C 3495 nt6.78□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 snR82snR82 268 nt6.78□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 YHC3YJL059W 1227 nt6.78□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 COS9YKL219W 1224 nt6.78□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 YLR194CYLR194C 765 nt6.78□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 RPS15YOL040C 429 nt6.78□□□□□ -1.32
CSI1Q04368 COX26YDR119W-A 201 nt6.77□□□□□ -1.33
CSI1Q04368 RSC30YHR056C 2652 nt6.76□□□□□ -1.33
CSI1Q04368 ASN2YGR124W 1719 nt6.76□□□□□ -1.33
CSI1Q04368 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt6.76□□□□□ -1.33
CSI1Q04368 TRK2YKR050W 2670 nt6.75□□□□□ -1.33
CSI1Q04368 HSF1YGL073W 2502 nt6.75□□□□□ -1.33
CSI1Q04368 CLB2YPR119W 1476 nt6.75□□□□□ -1.33
CSI1Q04368 IDP1YDL066W 1287 nt6.75□□□□□ -1.33
CSI1Q04368 YAP1801YHR161C 1914 nt6.75□□□□□ -1.33
CSI1Q04368 YOS9YDR057W 1629 nt6.75□□□□□ -1.33
CSI1Q04368 PIN2YOR104W 849 nt6.74□□□□□ -1.33
CSI1Q04368 UGO1YDR470C 1509 nt6.74□□□□□ -1.33
CSI1Q04368 CAD1YDR423C 1230 nt6.73□□□□□ -1.33
CSI1Q04368 YGR176WYGR176W 348 nt6.73□□□□□ -1.33
CSI1Q04368 HMS2YJR147W 1077 nt6.73□□□□□ -1.33
CSI1Q04368 DAL82YNL314W 768 nt6.73□□□□□ -1.33
CSI1Q04368 YNR048WYNR048W 1182 nt6.73□□□□□ -1.33
CSI1Q04368 PRP2YNR011C 2631 nt6.72□□□□□ -1.33
CSI1Q04368 GIR2YDR152W 798 nt6.72□□□□□ -1.33
CSI1Q04368 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt6.72□□□□□ -1.33
CSI1Q04368 BRL1YHR036W 1416 nt6.71□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 NMD5YJR132W 3147 nt6.7□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 SSK1YLR006C 2139 nt6.7□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 ESC8YOL017W 2145 nt6.7□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 CHO1YER026C 831 nt6.7□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 YLR317WYLR317W 435 nt6.7□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 ENT2YLR206W 1842 nt6.7□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 ACF2YLR144C 2340 nt6.7□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 RTT106YNL206C 1368 nt6.69□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 PIF1YML061C 2580 nt6.69□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 GPA1YHR005C 1419 nt6.69□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 RPT1YKL145W 1404 nt6.69□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 UTP7YER082C 1665 nt6.69□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 SYN8YAL014C 768 nt6.69□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 YLL059CYLL059C 507 nt6.69□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 NOG2YNR053C 1461 nt6.68□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 GPT2YKR067W 2232 nt6.68□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 IPI1YHR085W 1005 nt6.68□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 MRPL13YKR006C 795 nt6.68□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 TFS1YLR178C 660 nt6.68□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 PFA3YNL326C 1011 nt6.68□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 BAP2YBR068C 1830 nt6.68□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 TEF1YPR080W 1377 nt6.68□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 TEF2YBR118W 1377 nt6.68□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 ARP2YDL029W 1176 nt6.67□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 SFC1YJR095W 969 nt6.67□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 YJR115WYJR115W 510 nt6.67□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 YHR045WYHR045W 1683 nt6.67□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 MET8YBR213W 825 nt6.66□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 NUD1YOR373W 2556 nt6.66□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 SGE1YPR198W 1632 nt6.65□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 MTC5YDR128W 3447 nt6.65□□□□□ -1.34
CSI1Q04368 MTQ1YNL063W 945 nt6.64□□□□□ -1.35
CSI1Q04368 UBC4YBR082C 447 nt6.64□□□□□ -1.35
CSI1Q04368 EHD3YDR036C 1503 nt6.63□□□□□ -1.35
CSI1Q04368 HGH1YGR187C 1185 nt6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.7 ms