Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acvr1P37172 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Acvr1P37172 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acvr1P37172 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acvr1P37172 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acvr1P37172 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acvr1P37172 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acvr1P37172 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acvr1P37172 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acvr1P37172 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acvr1P37172 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acvr1P37172 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acvr1P37172 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acvr1P37172 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Acvr1P37172 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Acvr1P37172 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acvr1P37172 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Acvr1P37172 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Acvr1P37172 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acvr1P37172 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Acvr1P37172 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acvr1P37172 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acvr1P37172 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acvr1P37172 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acvr1P37172 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acvr1P37172 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acvr1P37172 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acvr1P37172 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acvr1P37172 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms