Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf239P24399 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf239P24399 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf239P24399 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf239P24399 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf239P24399 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf239P24399 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf239P24399 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf239P24399 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf239P24399 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf239P24399 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf239P24399 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf239P24399 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf239P24399 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf239P24399 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf239P24399 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf239P24399 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf239P24399 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf239P24399 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf239P24399 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf239P24399 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf239P24399 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf239P24399 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf239P24399 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf239P24399 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf239P24399 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf239P24399 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf239P24399 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf239P24399 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms