Protein–RNA interactions for Protein: P13705

Msh3, DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3P13705 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msh3P13705 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Msh3P13705 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh3P13705 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msh3P13705 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msh3P13705 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Msh3P13705 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Msh3P13705 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msh3P13705 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms