Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn3O88990 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn3O88990 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Actn3O88990 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Actn3O88990 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Actn3O88990 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn3O88990 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms