Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh3b2E9Q3E1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh3b2E9Q3E1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh3b2E9Q3E1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms