Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5M2

Gm10110, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10110D3Z5M2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm10110D3Z5M2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10110D3Z5M2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm10110D3Z5M2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms