Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kpna7C0LLJ0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna7C0LLJ0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kpna7C0LLJ0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna7C0LLJ0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna7C0LLJ0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna7C0LLJ0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna7C0LLJ0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna7C0LLJ0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna7C0LLJ0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna7C0LLJ0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna7C0LLJ0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna7C0LLJ0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna7C0LLJ0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna7C0LLJ0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna7C0LLJ0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna7C0LLJ0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna7C0LLJ0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna7C0LLJ0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna7C0LLJ0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna7C0LLJ0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms