Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clip3B9EHT4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip3B9EHT4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms