Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BC035947B2RQY6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BC035947B2RQY6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms