Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brpf3B2KF05 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brpf3B2KF05 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms