Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc38A3KMP2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc38A3KMP2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms