Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd60A2AMD2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd60A2AMD2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd60A2AMD2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ankrd60A2AMD2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms