Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C7

Znf728, Zinc finger protein 728, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf728Q6P5C7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Znf728Q6P5C7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf728Q6P5C7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms