Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx8Q9QXV1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx8Q9QXV1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms