Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad18Q9QXK2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad18Q9QXK2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rad18Q9QXK2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad18Q9QXK2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad18Q9QXK2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad18Q9QXK2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad18Q9QXK2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad18Q9QXK2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad18Q9QXK2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad18Q9QXK2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms