Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rcan3Q9JKK0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rcan3Q9JKK0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rcan3Q9JKK0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rcan3Q9JKK0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rcan3Q9JKK0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rcan3Q9JKK0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rcan3Q9JKK0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rcan3Q9JKK0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rcan3Q9JKK0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rcan3Q9JKK0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rcan3Q9JKK0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rcan3Q9JKK0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rcan3Q9JKK0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rcan3Q9JKK0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rcan3Q9JKK0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rcan3Q9JKK0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rcan3Q9JKK0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rcan3Q9JKK0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rcan3Q9JKK0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rcan3Q9JKK0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rcan3Q9JKK0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms