Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rhox9Q9EQM5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhox9Q9EQM5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhox9Q9EQM5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhox9Q9EQM5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhox9Q9EQM5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox9Q9EQM5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox9Q9EQM5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox9Q9EQM5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox9Q9EQM5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox9Q9EQM5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox9Q9EQM5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox9Q9EQM5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox9Q9EQM5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox9Q9EQM5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox9Q9EQM5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox9Q9EQM5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox9Q9EQM5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox9Q9EQM5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox9Q9EQM5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms