Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
4933428M09RikQ9D3X3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4933428M09RikQ9D3X3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms