Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D3J9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D3J9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D3J9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D3J9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D3J9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D3J9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D3J9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D3J9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D3J9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9D3J9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9D3J9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D3J9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms