Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Urm1Q9D2P4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Urm1Q9D2P4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Urm1Q9D2P4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Urm1Q9D2P4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Urm1Q9D2P4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms