Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc8Q9CYA6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc8Q9CYA6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc8Q9CYA6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc8Q9CYA6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc8Q9CYA6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc8Q9CYA6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zcchc8Q9CYA6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zcchc8Q9CYA6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zcchc8Q9CYA6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc8Q9CYA6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms