Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SelenomQ8VHC3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms