Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp27Q8CEG8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp27Q8CEG8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp27Q8CEG8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp27Q8CEG8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp27Q8CEG8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp27Q8CEG8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp27Q8CEG8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp27Q8CEG8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp27Q8CEG8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp27Q8CEG8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp27Q8CEG8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp27Q8CEG8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp27Q8CEG8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp27Q8CEG8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp27Q8CEG8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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