Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Bhlhe22Q8C6A8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms