Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcnpQ6P8I4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcnpQ6P8I4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcnpQ6P8I4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcnpQ6P8I4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcnpQ6P8I4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcnpQ6P8I4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcnpQ6P8I4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcnpQ6P8I4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcnpQ6P8I4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcnpQ6P8I4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcnpQ6P8I4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcnpQ6P8I4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcnpQ6P8I4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcnpQ6P8I4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcnpQ6P8I4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcnpQ6P8I4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcnpQ6P8I4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PcnpQ6P8I4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcnpQ6P8I4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcnpQ6P8I4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms