Protein–RNA interactions for Protein: Q64524

Hist2h2be, Histone H2B type 2-E, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2beQ64524 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hist2h2beQ64524 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist2h2beQ64524 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2beQ64524 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hist2h2beQ64524 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hist2h2beQ64524 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hist2h2beQ64524 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hist2h2beQ64524 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hist2h2beQ64524 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hist2h2beQ64524 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hist2h2beQ64524 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hist2h2beQ64524 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hist2h2beQ64524 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hist2h2beQ64524 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hist2h2beQ64524 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist2h2beQ64524 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist2h2beQ64524 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms