Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lcn3Q62471 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lcn3Q62471 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lcn3Q62471 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lcn3Q62471 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lcn3Q62471 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lcn3Q62471 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lcn3Q62471 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lcn3Q62471 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn3Q62471 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn3Q62471 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn3Q62471 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms