Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctf1Q60753 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctf1Q60753 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctf1Q60753 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctf1Q60753 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctf1Q60753 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctf1Q60753 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctf1Q60753 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctf1Q60753 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctf1Q60753 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctf1Q60753 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctf1Q60753 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctf1Q60753 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctf1Q60753 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctf1Q60753 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctf1Q60753 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctf1Q60753 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctf1Q60753 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctf1Q60753 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms