Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms