Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc125Q5U465 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc125Q5U465 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms