Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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D130052B06RikQ3UW13 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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D130052B06RikQ3UW13 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D130052B06RikQ3UW13 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
D130052B06RikQ3UW13 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
D130052B06RikQ3UW13 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
D130052B06RikQ3UW13 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
D130052B06RikQ3UW13 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
D130052B06RikQ3UW13 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
D130052B06RikQ3UW13 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
D130052B06RikQ3UW13 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
D130052B06RikQ3UW13 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D130052B06RikQ3UW13 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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