Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Ctu2Q3U308 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Ctu2Q3U308 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Ctu2Q3U308 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctu2Q3U308 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Ctu2Q3U308 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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