Protein–RNA interactions for Protein: P70436

Dlx4, Homeobox protein DLX-4, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dlx4P70436 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dlx4P70436 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dlx4P70436 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dlx4P70436 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dlx4P70436 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dlx4P70436 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dlx4P70436 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dlx4P70436 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dlx4P70436 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dlx4P70436 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dlx4P70436 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dlx4P70436 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dlx4P70436 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dlx4P70436 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dlx4P70436 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dlx4P70436 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dlx4P70436 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dlx4P70436 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dlx4P70436 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dlx4P70436 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dlx4P70436 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dlx4P70436 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms