Protein–RNA interactions for Protein: P42932

Cct8, T-complex protein 1 subunit theta, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct8P42932 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cct8P42932 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cct8P42932 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cct8P42932 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cct8P42932 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cct8P42932 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cct8P42932 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cct8P42932 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cct8P42932 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cct8P42932 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cct8P42932 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cct8P42932 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cct8P42932 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cct8P42932 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cct8P42932 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cct8P42932 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cct8P42932 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cct8P42932 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cct8P42932 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cct8P42932 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cct8P42932 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cct8P42932 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cct8P42932 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cct8P42932 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cct8P42932 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cct8P42932 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cct8P42932 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cct8P42932 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cct8P42932 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cct8P42932 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cct8P42932 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cct8P42932 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cct8P42932 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cct8P42932 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cct8P42932 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cct8P42932 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cct8P42932 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cct8P42932 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cct8P42932 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cct8P42932 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cct8P42932 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cct8P42932 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cct8P42932 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cct8P42932 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cct8P42932 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cct8P42932 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cct8P42932 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cct8P42932 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cct8P42932 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cct8P42932 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cct8P42932 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cct8P42932 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cct8P42932 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cct8P42932 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cct8P42932 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cct8P42932 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cct8P42932 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cct8P42932 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cct8P42932 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cct8P42932 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cct8P42932 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cct8P42932 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cct8P42932 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cct8P42932 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms