Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa2P28309 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa2P28309 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa2P28309 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa2P28309 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa2P28309 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms