Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tcrg-V1P06325 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms