Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nedd9O35177 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nedd9O35177 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms